卵巢的储备功能与自身免疫和一些酶缺陷疾病有关。研究发现，5%的临床实践是5%～卵巢功能不良的30%患有其他自身免疫性疾病。这些自身免疫性疾病包括桥本甲状腺炎、肾上腺功能减退(Addison)、糖尿病、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、腮腺炎、风疹等都会导致卵泡过度闭锁，从而导致卵巢储备功能下降。研究发现，约5%的患有腮腺炎的妇女最终可发展为卵巢早衰，桥本甲状腺炎是导致早发性卵巢功能不全的最常见疾病。
如果发现这些疾病，无疑会继续损害我们的卵巢功能，但相关手术也会对卵巢造成一定的损害。在妇科手术中，如子宫切除术、卵巢肿瘤剥除术、输卵管结扎或切除术、保守或半根治性子宫内膜异位症手术、盆腔输尿管手术、子宫动脉栓塞等，可能影响卵巢血液供应，部分电凝手术也可能破坏卵巢组织和血液供应。因此，如果发现卵巢有异常肿块，应及时就医，由专业医生进行综合评价，确定最佳手术方法和手术时间，找到卵巢疾病与手术之间的平衡，最大限度地保护卵巢功能。
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